L'Inquisizione portoghese è stata un istituto religioso analogo all'Inquisizione spagnola.
Fondata nel 1536, si diffuse alle colonie dell'impero portoghese e fu abolita ufficialmente nel 1821.
L'inquisizione portoghese fu istituita nel 1536 su richiesta del re João III.
In realtà, Manuel I aveva già avanzato richieste in tal senso, ma il papa si era rifiutato.
Così come in Spagna, l'Inquisizione fu posta sotto l'autorità del re.
Al suo vertice c'era un Grande Inquisitore, o Inquisitore Generale, nominato dal papa ma scelto dal re sempre all'interno della famiglia reale.
Il Grande Inquisitore, a sua volta, nominava gli altri giudici inquisitoriali.
Il primo Grande Inquisitore portoghese fu il Cardinale Enrico, fratello del re, che più tardi sarebbe divenuto re egli stesso.
Tribunali dell'Inquisizione furono istituiti a Lisbona, Coimbra ed Évora.
Il primo autodafé si tenne a Lisbona il 20 settembre del 1540.
Come per l'omologa Inquisizione spagnola, l'obiettivo principale di questa inquisizione, almeno inizialmente, furono quei convertiti (soprattutto ebrei, i conversos, appunto) che praticavano un Cristianesimo puramente formale mantenendo in segreto le proprie usanze religiose.
Col tempo l'Inquisizione passò alle colonie portoghesi sparse per il mondo (Brasile, Capo Verde e Goa, in India).
Anche nelle colonie, l'ambito primario di attività erano i nuovi convertiti, infatti, a rigore, i tribunali dell'Inquisizione potevano giudicare solo i battezzati.
Per i non battezzati si poteva al massimo procedere con la denuncia presso le autorità civili, ma in quel caso la competenza era della magistratura ordinaria.
Esattamente come accadde nel caso della Spagna, proprio il fatto che l'ambito di competenza della magistratura civile fosse limitato territorialmente, mentre quello della magistratura inquisitoriale si estendeva a tutti i battezzati ovunque si trovassero (quindi a tutto l'impero) fece sì che i sovrani si servissero degli inquisitori al di là degli scopi puramente religiosi.
Così i compiti dell'Inquisizione furono estesi, già da João III, alla censura sui libri, alla stregoneria e alla bigamia che invece, a rigore, era di competenza dei tribunali civili.
In questo modo l'Inquisizione diventava uno strumento per intervenire non solo nell'ambito della fede religiosa, ma anche della cultura, dei costumi, della società in generale.
A Goa l'Inquisizione fu stabilita nel 1560 da Aleixo Dia Falcão e Francisco Marques.
Il compito primario di questa Inquisizione asiatica era sorvegliare chi si era convertito al Cristianesimo dall'induismo.

Fonte: http://www.cultura-barocca.com/inquisizionep.htm